Hiện nay chưa có thuốc đặc trị tuyến trùng hại rễ trên cây cà phê mà chỉ có các loại thuốc có thể hạn chế sự gây hại của tuyến trùng. Để phòng trừ tuyến trùng có hiệu quả nên sử dụng thêm thuốc trừ nấm phòng trừ bệnh hại rễ cà phê. Không hỗn hợp hai loại thuốc này lại với nhau nếu trên bao bì không hướng dẫn. Các loại thuốc có thể thay đổi hàng năm. Tùy thuộc vào việc có tham gia các tổ chức sản xuất cà phê bền vững hay không để lựa chọn các loại thuốc được cho phép sử dụng trong danh mục hàng năm: 

- Không tham gia tổ chức chứng nhận cà phê: Sử dụng một trong các loại thuốc trừ tuyến trùng theo khuyến cáo trên bao bì: Abamectin (Tervigo 020 SC); Chitosan (Jolle 1SL, 40 SL, 50 WP); Clinoptilolite (Map Logic  90WP); Cytokinin (Geno 2005 2 SL); Paecilomyces lilacinus (Palila 500 WP (5 x 10^9 cfu/g), Benfuracarb (Oncol 20 EC), Carbosulfan (Marshal 5 GR), Ethoprophos (Vimoca 10 GR; Nisuzin 10 GR)...  

- Tham gia tổ chức chứng nhận cà phê của UTZ Certified, Rainforest Alliance: Sử dụng một trong các loại thuốc trừ tuyến trùng theo khuyến cáo trên bao bì: Abamectin (Tervigo 020 SC); Chitosan (Jolle 1SL, 40 SL, 50 WP); Clinoptilolite (Map Logic  90WP); Cytokinin (Geno 2005 2 SL); Paecilomyces lilacinus (Palila 500 WP (5 x 10^9 cfu/g), Benfuracarb (Oncol 20 EC), Ethoprophos (Vimoca 10 GR; Nisuzin 10 GR)...  

Sau đó xử lý một trong các thuốc trừ nấm: Copper Hydroxide (DuPontTM Kocide 53.8 DF; Cuprous Oxide (Norshield 58 WP).

- Tham gia tổ chức chứng nhận cà phê của 4C:  Sử dụng một trong các loại thuốc trừ tuyến trùng theo khuyến cáo trên bao bì: Abamectin (Tervigo 020 SC); Chitosan (Jolle 1SL, 40 SL, 50 WP); Clinoptilolite (Map Logic  90WP); Cytokinin (Geno 2005 2 SL); Paecilomyces lilacinus (Palila 500 WP (5 x 10^9 cfu/g)... Sau đó xử lý thuốc trừ nấm: Copper Hydroxide (DuPontTM Kocide 53.8 DF).